理論上說當然可逆，水體有自凈能力，但這種自凈能力是在湖泊生態(tài)系統(tǒng)還保持正常運轉(zhuǎn)的前提下，目前的湖泊污染是污染物的量遠遠超過湖泊自凈所能消耗的量，所以這個過程會很漫長。從另外一個角度來說，湖泊從貧營養(yǎng)化（也就是一般說的很清潔的水體）到富營養(yǎng)化最終到達濕地，其實是湖泊生態(tài)系統(tǒng)演替的自然流程而已，在無人工干預的前提下，環(huán)境給予湖泊的營養(yǎng)物質(zhì)有限，所以這個演替過程會非常漫長，但是人類排放的污染物（對于湖泊來說可以看作營養(yǎng)物質(zhì)）極大加速了這個過程。目前很多嚴重污染的水體的生態(tài)系統(tǒng)已經(jīng)喪失了這種自凈能力。
至于目前使用的水質(zhì)處理的措施。主要是針對集中排放的污水處理，對于湖泊水質(zhì)的改善，這只是減少污染來源而已，這些措施如果直接用于治理湖泊這么大體量的水體，成本會非常高。此外，對于污染已經(jīng)很嚴重的水體來說，水底污泥也是主要的治理對象，但是成本也非常高。其實這是一個很復雜的過程，大致來說比如藻類的繁殖，以藻類為食的浮游動物和以分解藻類尸體為生的細菌也大量繁殖，從而大大降低水中溶氧量。同時藻類覆蓋在水體表面，阻擋陽光和氧氣進入水體，原本可以在水下產(chǎn)生氧氣的藻類也只在表面繁殖。最后造成厭氧使魚蝦逐漸死亡。
