菊花品種繁多，頭狀花序皆可入藥，味甘苦，微寒，散風(fēng)，清熱解毒。這就是藥菊。按頭狀花序干燥后形狀大小，舌狀花的長度，可把藥菊分成 4 大類，即白花菊、滁菊花、貢菊花和杭菊花四類。在每一類里則根據(jù)原產(chǎn)地取名。在白菊花類里，以產(chǎn)安徽亳縣的亳菊品質(zhì)最佳，其次如河南武陟的懷菊，四川中江的川菊，河北安國的祁菊，浙江德清的德菊等。 由于菊花栽培歷史悠久，中國歷代都相繼有關(guān)于菊花品種的大體記錄和分類——菊譜的出現(xiàn)。
1967 年湯忠皓對菊花品種提出過一個(gè)較為完整的分類法，他根據(jù)花徑的大小分為滿天星和大花兩個(gè)大區(qū)，然后再根據(jù)頭狀花序中舌狀花與管狀花數(shù)量之比，在每個(gè)區(qū)里分舌狀花系與管狀花系，最后依據(jù)瓣型及瓣化程度分成類與型。在滿天星區(qū)里，舌狀花系有3 類4 型：平瓣類：①平瓣小菊型；匙瓣類：②匙瓣小菊型，③蜂窩小菊型；管瓣類：④管瓣小菊型。在盤狀花系里有 1 類 2 型：托柱類：⑤平柱小菊型，⑥管柱小菊型。在大花區(qū)里，舌狀花系有 4 類 21 型：平瓣類：⑦寬瓣型，⑧芍藥型，⑨翻卷型；匙瓣類：⑩蓮座型， (11) 卷散型， (12) 舞蓮型， (13) 圓球型， (14) 舞球型；管瓣類： (15) 圓盤型， (16) 疏管型， (17) 管球型， (18) 翎管型， (19) 枯針型， (20) 紐絲型， (21) 散發(fā)型， (22) 大勾環(huán)型， (23) 小勾環(huán)型， (24) 垂珠型， (25) 飛舞型， (26) 龍爪型；毛刺類： (27) 毛刺型。盤花系里有 3 類 3 型：平瓣托柱類： (28) 平瓣托柱型；匙瓣托柱類： (29) 匙瓣托柱型；管瓣托柱類； (30) 管瓣托柱型。
1982年，中國園藝學(xué)會(huì)花卉盆景協(xié)會(huì)菊花品種分類學(xué)術(shù)討論會(huì)經(jīng)過研究，對菊花的分類做了統(tǒng)一界定，分5類30型。分別是：（1）平瓣類：寬帶、荷花、芍藥、平盤、翻卷、疊球；（2）匙瓣類：匙荷、雀舌、蜂窩、蓮座、卷散、匙球；（3）管瓣類：單管、翎管、管盤、松針、疏管、管球、絲發(fā)、飛舞、鉤環(huán)、貫珠、針管；（4）桂瓣類：平桂、匙桂、管桂、全桂；（5）畸瓣類：龍爪、毛刺、剪絨。
分類學(xué)家對菊花的原祖有一些不同看法，或認(rèn)為野菊（ Dendranthema indicum ）是菊花的祖先，或認(rèn)為小紅菊（ Dendranthema chanetii ）、甘菊（ Dendranthema lavan-dulaefolium ）是原祖。可以肯定的是菊花不是單元起源的，不能用簡單的種系發(fā)生方法來概括。
注意：菊花品種繁多，但不可混種否則極易串種影響品質(zhì)。
