食用菌種植過程中，離不開菌種的配置，不同品種菌種配方有一定的差異。
草菇菌種配方：稻草30%、廢棉50%、玉米粉17%、復合肥1%、石灰粉2%。木耳菌種配方：棉籽殼44%、木屑44%、麥麩10%、糖1%、石灰1%、石膏1%。平菇菌種配方：棉籽殼80%、稻草粉10%、麩皮8%、石灰2%。金針菇菌種配方：棉籽殼38%、麩皮32%、淋水陳積雜木屑25%、玉米粉3%、輕質(zhì)碳酸鈣0.5%。
